Protein ZmDOF3 | |
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Information | |
TF Name: | ZmDOF3 |
Species: | Maize |
TF Family: | C2C2-Dof |
Gene Name(Synonym): | PBF1 |
Uniprot ID: | A0A1D6PDQ1 |
ZmDOF3 is a protein in the C2C2-Dof family. NOTE the "Uniprot ID" shown on the right is a placeholder for testing. The interactive structure shown is based on that id.
Overview of domains present in v5 transcripts | |||
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PF00076 | PF02701 | PF14570 | |
Zm00001eb094340_T001 | |||
Zm00001eb094330_T001 | |||
Zm00001eb094340_T002 | |||
Zm00001eb094340_T003 | |||
Zm00001eb094340_T004 | |||
Zm00001eb094340_T005 |
Gene ID | Type | MEME Logo | Sequence | FIMO | Position |
---|---|---|---|---|---|
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Zm00001d005100 | DAPseq | sequence | fimo | position | |
Zm00001d005100 | ChIPseq | sequence | fimo | position | |
Zm00001d005100 | PChIPseq | sequence | fimo | position |
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EVNKLHMLGSNDIHNRAFGM
Secondary Structure Color Code | |
---|---|
BEND | region with high backbone curvature without specific hydrogen bonding |
HELX_LH_PP_P | left-handed polyproline helix |
HELX_RH_3T_P | right-handed 3-10 helix |
HELX_RH_AL_P | right-handed alpha helix |
HELX_RH_PI_P | right-handed pi helix |
STRN | beta strand |
TURN_TY1_P | type I turn |
UNDETERMINED | no data available |
Domains Present | |
---|---|
PF14570 |
|
PF00076 |
|
Hover here to show all domains |
GTATGGATGAGTTTGGTTTGGCCAC...
GTATGGATGAGTTTGGTTTGGCCACAGCAAAGTGAAGACACAGAGAATCCACAACGCAAGCGCCCCCTTCCTTCTTTCTCTACACCCTGCAGGCGCAGGCACAGCGCATTGCCCCCCTCCTTGTCCAGCGCCCCCAACCACAAGGAGTCAAGGAACAGGACGACCATGAGCGACGATGGCGACCGAACCTGCCCGCTCTGTGCCGAGGAGATGGACACTACTGACCAGCAGCTCAAGCCATGCAAATGCGGCTATGATATTTGTGTTTGGTGCTGGCACCACATCATAGACATGGCTGAGAAGGAGGAAACAGTGGGCCGCTGCCCTGCATGCCGCACATGCTATGACAAGGACAGGATCGTCAAGATGGCTGCCACTTGTGACAGGACGGTGGCAGATAAAAATGTAGAGAAGAAGCACAAGACCCAAAAGGTTAAGCCAAAGGCAGCACCCACAGCAGCAGCAACATCAACCGTAGAATCAAAGAAGCATCTGGCTAGTGTCAGGGTTATCCAGAGAAATCTGGTGTATATAATTGGGCTACCTGCACATTTATGCAACGAGAGTGTGCTTGAGTGTAGGGAGTACTTTGGTCAATATGGGAAAGTTTTGAAGGTTTCAGTTTCCCGTCCGACTGGGCCTCCCTCTCAGCAGGCATCAGCAACCAGCAATATTAGTGTGTATATTACTTATGCGAAAGAAGAGGAGGCCATCCGGTGTATTCAGGCTGTACACAATTTTGTCTTGGAAGGGAAAGTGTTAAGGGCATGTTTCGGTACTACGAAGTATTGCCATGCATGGCTGCGAAACATGGCATGTGGGAATCCAGATTGTCTCTATTTGCATGATGTAGGCAGTCAGGAGGATAGTTTTACTAAAGATGAGATCATCTCAGCATATACAAGGACTAGAGTCCCCCAGATGGCATCTAGTGTTTCGCAAAGACGTACAGGCACTGTGTTACCTCCTCCAGGAGATGATTTCTCTCACAGTGCGGTGGTTTCAGCCAAGCATACATTCAAGAATGGAACACTTAATACCACCAGTCAGCCCAGACTTTCACCTCCAAACAGTAGTTCTGGGAGGTCCACGCTTCCACCAGCTGCATCATGGGGGCAGCGTGATTTGAATGCCAGGATAACAGCTACTGGAGCGACATCATCACAATCTCATACAAAACCAAAATCAGAATCACAGAGTAATCCATTTTCAAGTTCTTCAGCAATTTCCAGTACAAAAACACCCTCTTCATGGAATGATGATACAAGTACAGCAGCAAAAATGCCTGAAGGACAGCAAGTGTCAGAAAAAGAGTCTAAAACCTTGCAGCCGTATAAGCCTGGTATTTCAAAGGAAACACAAGCTCTATCGTCACTGGAGTCATCACTGGACATAGACTTCTCAACAATACCTTCAGCTTGGAATGATGATGACATTGTAGTATCAGATGGGATGCCAAAAGGAAGCGATGAAAATCAAGTTCCAAATAAAAATGGTGAGCTAACCCATCCAGCATCTAAGTCACTGGTTTTATCTAAGAAAGACATAGAAATGAACATTACCAGCAAAAATCCTTCAGATTTTTTATCAAGTCTAGCAATATCTAAATTAGATGTAAGTACTAGTGATGGTGACCACTCAGATACCAATATTACTCCTAAAAGCCTTACTTCAAATGCTGTAGAATGCCAATCTTGTCATGCTGCTGGGGAGAAAATGTTGGAGGATATTGGATCCAAGGACATCGACATGGAGAAGATATCTTCTCAGATATCTTCAGTAACATTAGGTGGCAACGATAAGATTCAGAGTATGGCAGGAAATCAGCAACCAGATGTAATGCCATGCACATCTATTGATGTGCCCATGGATCAGAATTTTGGCAGAGACCGATCTCATCTCAATCTTAACGAGCTTTTATTGCCTTCAGAAAATAAGGATAGTAGTCTTTCTTGTCAATATAGTTCTGATAAGCGTCTTGCTTGGAGTTTGAAGATGCAAAATTGTAGCGTTACTCCTTTAAATGATACAATAGACTCTGCAATGCTCACTGACAAACCTTATAGTATACTGCTGGAAGGTTCAGAGAAACCATCATATCCACCATTTGTTGAATTTCCTAGTACATGGGATACCTCATTGTGGAATGATACAAAAAATAACGCTGCATCGACGATTGACACTATAACTTCTTCACAGATGCAGACAGGGTTTTCTTCAATCGATAACACTTATGCCTTGCTAAATGGAGGTCAAGATGGGCTAGGTACTGTATATACACATGATAATGTTTCTGTATATACACGTGGACGTGGTAATGTTTCTGGACATCCTGGAATGGGAAGTCATCAGCATAGAGCAATGGGTTCAGTAAGAACTGATAGTATAGGAAGTTTTGACAAGACCATAAGCGTAAATAAGGATGAGAGCAGAATAATTTCTGATACGTTGTCAGAGTTTAATCCATGGGATGATTCATATTCGACTGCTAACAATTTTGTTAGGATGCTTAGGGAATCTGAAAATAATGATGTTCAGTGCACTGCGCCTTCATGGAAATCAGGAACCGGGAGCAAACAGTCCAGATTTTCATTTGCTAGACAGGATAACCAAGGAAACTTGTTGGATTCATCTCTCAGAAACTGTGGTATTGGTACTGAGCAGAATTTCAGTTTGCTACCCCAGAATTCTCGAAGAAATATTTACCAGAATGGTCTTGCATTCCAATCTCTAGAGAATGAATTTTCAAATAGTAACTTTCCTGGTCTATTAGATATGGCAACTACTGGTACATCAATGTCTAAAATATCTGCTCCCCCAGGATTTTCAGCACCAACAAGAGTACCCCCTCCTGGATTTTCTACTGCATTTCCATCCCAGGATAGTTTGAACCCCACTCCTGGGTTTCCTTCTGGGATTTTGTCTCATGATGGGTCTATCCCCCTTTCTAGATTCCCTTCATTTTCTTCTGGAGTTTCAGCTCAGGAAGTGTCTAAGCTCCCTACTAGACTGCCTTCTCCATTTTCTTCTAGATTTTCATCACAGGATGGTCCTGATCCCCCTTCTAGATTCCCTTTTTCTTCTGGGTTCACATCACAGGATGGGTCTAATCAGTTGTATGGCTCAACAAACCCAGAAAATCTTCTCGGGGGTACTGTTCTGGGTGTCGACGGTAATCATTATCAATCTCAGTTTGGAAGGCACTCAAGTGACATGGAGTTTGATGATCCTGCTATATTAGCTGTGGGCAAAGGGCTGATGCCTGGAATTGGCGATTCAGGGCTGGAGATGAAAAATACTCGTGCTTCACAGTTGCAACCAGCAAGTAGTGATCCAAGATTTCAGCTACATGTACAGCCAAATGTGCAGTCTCATCAAAACATGAGATTCACAGACCCTGTGCAAGATGGTTTGAACCATATGAATGATAATTACCTGGCATCCAGATTTTTAGCTCAGAACCATGGTCCTCTATCTCCTTATGTGCAGATTCCGCAACAACCCAGAAACTCGCAGGTTACAAATGGTCACTGGGACGGGTGGAGTGAATCGAGACAAGGGAATAACATTCCTATGTCAGACATGTCCAGGATATTATATCCAAGTGAAGTGAACAAGTTGCACATGCTGGGTTCAAACGATATCCATAACAGAGCCTTTGGAATGTGATTGTCTCCTGGGATAATGTGTGACTTTGAGCTGACATATTCGCTTGGGGCGTTTTGTGGAAGTAACTGGTTGCACAAAACATAGTATACCTGAGGTGGTTAATGGTGTTGTGCTTATGAGCTGGCACACAATATTTATTGCTATTGGAGTTGACCAAAATGAACCTTAGTTTTGGTCCAGCCAGTTGAAATTACCAGGTTCATTCTCGTCTATGATTTGTGACGCTTGAATGAAAAGAACGAGAAGAACAAGGCAGCTGAAGTTGAAATAGATATAGAGATATGTCTATCATGGGATTTGGGGCGACCTGTGAGTGAAAGAAGCTTAGGTGTGGCAGTTTGTTTTTCTTGTGTCTGTACATGATGATATTGGTCGGTGGTTGTAGTATAATTTGGTGATCGGCGGTGGCTGTATTAACTTGTAGTGGTTGCTCTTGCTCCCTCTTGCTTGTTTATGTTAATTAAGGGAATTGAGGTGAAGGTCTAGTGTTACCCATAGCATAATAATATACGATACATAACTGGTTTCTTTGCTAGCATTACTTCATTTGTTTCAACAACAGCAAAAAAGAAATCCCTTAACCTTTCTTAAAAACGGACACTTTGTTACCGTGCATTGAGAATACCCTTGGAGAAGCTTCTGAACTACATTACACATAGGTCTATGTGGTGCTTGAGGCCAGAGGTTTGAGTTGTATTGTCAAAACTCCTTCGGGCCTCCGCACTCTGTGTACTAGGTCGGCG
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